基于組學(xué)技術(shù)的L-精氨酸合成途徑優(yōu)化研究，主要是通過基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)等技術(shù)，深入了解其合成途徑的分子機(jī)制，從而找到關(guān)鍵基因和代謝節(jié)點(diǎn)進(jìn)行調(diào)控。具體內(nèi)容如下：

基因組學(xué)應(yīng)用：借助基因組學(xué)可明確微生物中L-精氨酸合成相關(guān)基因的全貌。如確定編碼關(guān)鍵酶的基因，像催化前體L-谷氨酸合成乙酰谷氨酸的ArgA基因，以及參與后續(xù)反應(yīng)的ArgB、ArgC等基因，還可了解這些基因在染色體上的分布及調(diào)控元件，為基因編輯提供靶點(diǎn)，例如，利用CRISPR-Cas9等基因編輯技術(shù)，在大腸桿菌染色體上過表達(dá)精氨酸合成相關(guān)靶基因，可避免質(zhì)粒載體過表達(dá)基因的不穩(wěn)定問題，減少細(xì)胞代謝負(fù)擔(dān)，有利于提高L-精氨酸產(chǎn)量。

轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用：通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析，能知曉不同生長(zhǎng)階段和環(huán)境條件下L-精氨酸合成相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄水平。如在鈍齒棒桿菌發(fā)酵生產(chǎn)L-精氨酸時(shí)，取對(duì)數(shù)期發(fā)酵樣品進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析，可挖掘出與離子轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)的基因，研究其在精氨酸快速合成階段對(duì)菌株生長(zhǎng)及精氨酸合成的影響，進(jìn)而通過調(diào)控這些基因來優(yōu)化合成途徑。此外，還可據(jù)此確定哪些基因受終產(chǎn)物反饋抑制或其他因素調(diào)控，為解除抑制、提高基因表達(dá)量提供依據(jù)。

蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用：蛋白質(zhì)組學(xué)可用于研究精氨酸合成途徑中蛋白質(zhì)的表達(dá)和修飾情況，能確定關(guān)鍵酶的表達(dá)水平，若某些關(guān)鍵酶蛋白表達(dá)量低，可通過強(qiáng)化其基因表達(dá)來提高酶量，促進(jìn)L-精氨酸合成。同時(shí)，分析蛋白質(zhì)的翻譯后修飾，如磷酸化、乙?；龋@些修飾可能影響酶的活性和穩(wěn)定性。通過了解修飾機(jī)制，可人為干預(yù)以優(yōu)化酶的功能，如通過調(diào)控使關(guān)鍵酶保持高活性狀態(tài)，加速L-精氨酸合成反應(yīng)。

代謝組學(xué)應(yīng)用：代謝組學(xué)有助于分析L-精氨酸合成途徑中的代謝產(chǎn)物變化，可確定中間代謝產(chǎn)物的積累情況，若發(fā)現(xiàn)某中間產(chǎn)物大量積累，可能是后續(xù)反應(yīng)的酶活性不足或存在反饋抑制，可針對(duì)性地調(diào)整相關(guān)基因或酶的表達(dá)。還能分析細(xì)胞內(nèi)整體代謝輪廓，了解與L-精氨酸合成相關(guān)的碳代謝、氮代謝等途徑的關(guān)聯(lián)，通過調(diào)控其他代謝途徑為其合成提供更多前體物質(zhì)和能量，例如，通過代謝組學(xué)發(fā)現(xiàn)三羧酸循環(huán)中間產(chǎn)物α-酮戊二酸是L-谷氨酸合成的關(guān)鍵前體，可通過調(diào)控異檸檬酸脫氫酶等，引導(dǎo)α-酮戊二酸更多流向L-谷氨酸，進(jìn)而增強(qiáng)L-精氨酸的合成通量。

本文來源：西安浩天生物工程有限公司官網(wǎng)http://m.krtbdb.com/