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CRISPR-Cas9技術(shù)在L-精氨酸高產(chǎn)菌株構(gòu)建中的應(yīng)用

發(fā)表時(shí)間:2025-07-24

CRISPR-Cas9技術(shù)憑借其精準(zhǔn)、高效的基因編輯能力,在L-精氨酸高產(chǎn)菌株構(gòu)建中展現(xiàn)出顯著優(yōu)勢,通過靶向改造微生物的代謝通路、調(diào)控基因表達(dá)及解除反饋抑制等方式,大幅提升它的合成效率,具體應(yīng)用如下:

一、增強(qiáng) L -精氨酸合成的關(guān)鍵通路基因表達(dá)

L-精氨酸的生物合成途徑涉及多個(gè)關(guān)鍵酶,如谷氨酸激酶(proB)、谷氨酸-5-半醛脫氫酶(proA)、鳥氨酸氨甲酰轉(zhuǎn)移酶(argF/argI)等。CRISPR-Cas9可通過以下方式強(qiáng)化該通路:

激活關(guān)鍵基因啟動(dòng)子:利用CRISPR激活系統(tǒng)(如dCas9結(jié)合激活因子)靶向修飾關(guān)鍵酶基因的啟動(dòng)子區(qū)域,提高其轉(zhuǎn)錄效率。例如,在大腸桿菌或谷氨酸棒桿菌中,針對argC(編碼 N -乙酰谷氨酸激酶)、argG(編碼精氨琥珀酸合成酶)等基因的啟動(dòng)子進(jìn)行編輯,增強(qiáng)其表達(dá)水平,從而推動(dòng)代謝流向 L -精氨酸合成方向傾斜。

拷貝數(shù)擴(kuò)增:通過CRISPR-Cas9介導(dǎo)的同源重組,將L-精氨酸合成相關(guān)的基因簇(如 arg 操縱子)整合到菌株的染色體多拷貝位點(diǎn)或質(zhì)粒中,增加基因劑量,提升酶的合成量,加速前體物質(zhì)向產(chǎn)物的轉(zhuǎn)化。

二、敲除或弱化競爭通路與分解代謝基因

微生物代謝網(wǎng)絡(luò)中,與L-精氨酸合成相關(guān)的競爭通路(如脯氨酸、谷氨酸等其他氨基酸的合成途徑)會(huì)消耗共同前體(如谷氨酸),而它的分解代謝基因(如 argE 編碼的乙酰鳥氨酸酶)則會(huì)降解產(chǎn)物,降低積累量。CRISPR-Cas9可精準(zhǔn)敲除或弱化這些基因:

阻斷競爭通路:例如,敲除脯氨酸合成關(guān)鍵基因proB,減少谷氨酸向脯氨酸的分流,使更多前體用于L-精氨酸合成;在谷氨酸棒桿菌中,敲除丙氨酸轉(zhuǎn)氨酶基因alaT,降低丙氨酸對谷氨酸的消耗,提升它的前體供應(yīng)。

抑制分解代謝:敲除或沉默argR(編碼L-精氨酸阻遏蛋白)可解除其對arg操縱子的抑制,同時(shí)敲除argD(編碼乙酰鳥氨酸轉(zhuǎn)氨酶)等分解相關(guān)基因,減少它的降解,促進(jìn)產(chǎn)物積累。

三、解除反饋抑制與調(diào)控系統(tǒng)

L - 精氨酸合成過程中,關(guān)鍵酶常受終產(chǎn)物的反饋抑制,例如谷氨酸激酶(proB編碼)會(huì)被L-精氨酸或脯氨酸抑制,限制合成效率。CRISPR-Cas9可通過定點(diǎn)突變改造這些酶的編碼基因,消除反饋抑制:

定點(diǎn)突變關(guān)鍵酶基因:針對proB基因中與反饋抑制相關(guān)的氨基酸位點(diǎn)進(jìn)行編輯(如將大腸桿菌proB基因的第143位甘氨酸突變?yōu)樘於彼幔雇蛔兒蟮墓劝彼峒っ覆辉偈?/span>L-精氨酸抑制,持續(xù)催化反應(yīng)進(jìn)行。

改造調(diào)控蛋白:敲除或突變L-精氨酸的全局調(diào)控基因(如某些轉(zhuǎn)錄抑制因子基因),解除其對合成通路的負(fù)調(diào)控,確保關(guān)鍵基因持續(xù)表達(dá)。

四、優(yōu)化菌株的生長與代謝適應(yīng)性

高產(chǎn)菌株需在積累大量L-精氨酸的同時(shí)保持良好的生長狀態(tài),CRISPR-Cas9可通過改造細(xì)胞膜轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因或應(yīng)激相關(guān)基因,提升菌株的耐受性和物質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)效率:

增強(qiáng)產(chǎn)物外排:編輯L-精氨酸轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因(如 argT),增強(qiáng)其外排功能,減少胞內(nèi)產(chǎn)物積累對細(xì)胞的毒性,同時(shí)避免反饋抑制的激活。

提升環(huán)境適應(yīng)性:敲除或修飾與氧化應(yīng)激、滲透壓應(yīng)激相關(guān)的負(fù)調(diào)控基因,增強(qiáng)菌株在高密度發(fā)酵環(huán)境下的存活能力,確保代謝效率穩(wěn)定。

通過上述多維度的基因編輯策略,CRISPR-Cas9 技術(shù)可精準(zhǔn)重塑微生物的代謝網(wǎng)絡(luò),顯著提高L-精氨酸的合成效率,為工業(yè)化高產(chǎn)菌株的構(gòu)建提供了高效、可控的技術(shù)手段,目前已在大腸桿菌、谷氨酸棒桿菌、釀酒酵母等菌株中實(shí)現(xiàn)了L-精氨酸產(chǎn)量的大幅提升。

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